醫健通（資助）系統旨在支援長者醫療券計劃及疫苗資助計劃的管理及監管。醫療券透過網上系統發放及使用，以取代實體券，長者並可於網上或致電經系統查詢醫療券的結存。而在疫苗資助計劃中，醫護提供者為病人注射疫苗前，可透過醫健通（資助）系統查閱病人的疫苗接種紀錄，以避免重複注射疫苗及加強保障病人安全。